נהרות טג'יקיסטן
נהרות טג'יקיסטן זורמים במלואם ושייכים בעיקר לאגן ים ארל. ורק מעטים נופלים למימי אגם קרקול או נהר הטרימה.
נהר אמו דריה
הערוץ של האמו דריה עובר בשטח של ארבע מדינות בבת אחת - אפגניסטן, טג'יקיסטן, אוזבקיסטן וטורקמניסטן. האורך הכולל של הערוץ הוא 2400 ק"מ. מתוכם 1,415 קילומטרים עוברים במדינה. מקור האמו דריה נוצר על ידי מפגש של שני נהרות - וקש ופיאנג '. שפת הנהר הם מי ים ארל (יוצר דלתא גדולה כשהוא זורם).
יש כמה יובלים ליד הנהר. בממוצע נהר אמו דריה מקבל את המים של קפירניגן, סורקהנדריה ושארבד, כמו גם יובל שמאלי אחד - נהר הקונדוז. והמשך, עד למפגש, אין יובלים נוספים. מימי הנהר משמשים באופן פעיל ולכן העמודרייה אינה מגיעה לים ארל. זו הייתה אחת הסיבות להתייבשותה..
במימי האמו דריה חיים לא מעט זנים שונים של דגים: אספ; אדם קירח; שפמנון ארל; אַבְרוֹמָה; שכון; קרפיון כסף; אמור לבן; ממזר.
נהר ואנץ '
אחד הנהרות, שתעלה נמצא אך ורק על שטחה של טג'יקיסטן. זהו יובל ימין של נהר פאנג '. אורכו הכולל של הנהר הוא 103 קילומטרים. המקור נוצר על ידי מפגש של שני נהרות - האחד יורד מהקרחונים של רכס הוונץ ', והשני מרכס האקדמיה למדעים (המדרון המערבי). הערוץ פועל בין טווחי ואנץ 'לדרווז.
נהר קשקאדריה
מבחינה גיאוגרפית, שדרת הנהר עוברת דרך אדמות טג'יקיסטן (אזור סוגד) ואוזבקיסטן (אזור קשקדריה). כמקובל, לנהר יש שלושה שמות: בחלק העליון העליונים - אוביהונדה; מנה אמצעית - שינאצ'אסאי; תחתון - Maimanakadarya.
האורך הכולל של הערוץ הוא 378 ק"מ. מקור הנהר ממוקם בגובה 2960 מטר מעל פני הים ונוצר על ידי שני נהרות חסרי שם. יובלים עיקריים: אקדריה (Aksu); Tanhidizadarya; גוזרדריה.
נהר מוקסו
האורך הכולל של הערוץ הוא 88 ק"מ. מוקסו ממוקם באזור ג'ירגטל בטג'יקיסטן. המקור הוא מפגש של שני נהרות: Seldar ו- Sauksoy (קרחוני פדצ'נקו והגדול Saukdar הגדול).
נהר קוזילסו
קיזילסו, שפירושו «נהר אדום», זורם בשטח קירגיזסטן וטג'יקיסטן. המקור הוא מורדות רכס זעלי. האורך הכולל של הערוץ הוא 235 ק"מ. במפגש עם נהר מוקסו מוליד נהר וקש.
נהר וקש
אורכו הכולל של תעלת הנהר הוא 786 קילומטרים וכולם עוברים בשטחה של טג'יקיסטן. מקורו של הנהר הוא במורדות הפאמירים, אך מקום מפגשו עם מי נהר פיאנז 'מוליד את אמו דריה הגדולה. הנהר הוא המקור העיקרי להשקיה וכן לייצור חשמל.